WinRoute führt NAT auf der niedrigsten Netzwerk-Protokollschicht aus. Das Programm überprüft den Datenverkehr zwischen dem Treiber der Netzwerkkarte und dem TCP-Stack. Es kontrolliert den Internetdatenverkehr vollständig, indem es sowohl ausgehende als auch eingehende Pakete erfasst. Somit ist maximale Sicherheit gewährleistet. Diese Funktion zeichnet die NAT-Implementierung von WinRoute aus. WinRoute bietet außerdem zusätzliche Sicherheitsfunktionen, wie eine auf Paketfilter basierende Firewall und Anti-Spoofing. Mit NAT von WinRoute ist das gesamte Netzwerk einschließlich des Computers, auf dem WinRoute ausgeführt wird, geschützt.