Um den Mail-Server hinter WinRoute auszuführen, wird empfohlen, zwei Einträge zur Anschlusszuordnung zu erstellen - einen für das SMTP-Protokoll (wird an Port 25 ausgeführt) und eines für das POP3-Protokoll (wird an Port 110 ausgeführt). So können andere SMTP-Server Ihren SMTP-Server erreichen und Sie können Ihre E-Mail über POP3 aus dem Internet abholen.

Falls der MAIL-Server auf dem WinRoute-Computer ausgeführt wird, muss die Anschlusszuordnung eingerichtet werden. Dies liegt an der Position des Inspektionsmoduls von WinRoute, das unterhalb des TCP-Stacks arbeitet, so dass die Pakete verändert/abgelehnt werden, bevor sie das Betriebssystem erreichen.